Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CdsnQ7TPC1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CdsnQ7TPC1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms