Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp397Q7TNK4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp397Q7TNK4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp397Q7TNK4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms