Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbno2Q7TNB8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms