Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms