Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms