Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Higd1cQ76I25 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Higd1cQ76I25 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms