Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nme8Q715T0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms