Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sned1Q70E20 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms