Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms