Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ncapd3Q6ZQK0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.3 ms