Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup188Q6ZQH8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup188Q6ZQH8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms