Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
March6Q6ZQ89 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms