Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ift172Q6VH22 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms