Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clca4aQ6Q473 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4aQ6Q473 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4aQ6Q473 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4aQ6Q473 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4aQ6Q473 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4aQ6Q473 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca4aQ6Q473 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms