Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup98Q6PFD9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup98Q6PFD9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms