Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dtx4Q6PDK8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dtx4Q6PDK8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms