Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc2Q6PDG5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms