Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcrQ6PAJ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms