Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atl2Q6PA06 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atl2Q6PA06 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms