Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mtss1lQ6P9S0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mtss1lQ6P9S0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtss1lQ6P9S0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms