Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam222bQ6P539 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms