Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sik3Q6P4S6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sik3Q6P4S6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sik3Q6P4S6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms