Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Podnl1Q6P3Y9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms