Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hdac10Q6P3E7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hdac10Q6P3E7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms