Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms