Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casc4Q6P2L7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casc4Q6P2L7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casc4Q6P2L7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casc4Q6P2L7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casc4Q6P2L7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casc4Q6P2L7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casc4Q6P2L7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms