Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp4r3aQ6P2K6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms