Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc189Q6NZQ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms