Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Soga3Q6NZL0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Soga3Q6NZL0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Soga3Q6NZL0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms