Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rprd2Q6NXI6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rprd2Q6NXI6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rprd2Q6NXI6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms