Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HelbQ6NVF4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HelbQ6NVF4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms