Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg16l2Q6KAU8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg16l2Q6KAU8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms