Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltbQ6IRU5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CltbQ6IRU5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms