Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ParpbpQ6IRT3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ParpbpQ6IRT3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms