Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms