Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nop58Q6DFW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms