Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdzrn3Q69ZS0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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