Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk13Q69ZA1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk13Q69ZA1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk13Q69ZA1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms