Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CltcQ68FD5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms