Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprdQ64487 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprdQ64487 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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