Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf4Q64310 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms