Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PatjQ63ZW7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PatjQ63ZW7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PatjQ63ZW7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms