Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a5Q63ZW6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col4a5Q63ZW6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms