Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ss18Q62280 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ss18Q62280 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ss18Q62280 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ss18Q62280 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ss18Q62280 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ss18Q62280 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ss18Q62280 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18Q62280 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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