Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Kdm5dQ62240 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Kdm5dQ62240 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Kdm5dQ62240 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms