Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema4bQ62179 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema4bQ62179 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms