Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm38Q62176 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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