Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a1Q61165 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a1Q61165 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a1Q61165 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a1Q61165 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a1Q61165 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a1Q61165 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a1Q61165 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a1Q61165 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a1Q61165 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a1Q61165 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms