Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp7Q60973 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms