Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbbp4Q60972 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms